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Un algorithme pour découvrir les signatures de gènes
Recherches médicalesUne équipe de l'Université de McMaster, Ontario, Canada, a développé un algorithme qui permet l'identification d'une signature de 20 gènes et ainsi permet une certaine classification du cancer du sein.

Les chercheurs ont utilisé un groupe de validation de 144 patients pour "apprendre" à l'algorithme à identifier les gènes dont les niveaux d'expression sont en corrélation avec la survie des patients. Les 10 gènes classés les moins bons et les 10 gènes classés les meilleurs dans l'établissement des pronostics sur le groupe de validation forment un système de prédiction, dit à 20 gènes, qui prédit les pronostics aussi bien que les autres modèles appliqués au groupe de validation.

Qui plus est, cet algorithme, implémenté dans le logiciel Microsoft Excel version 2007, permet d'engendrer des signatures de gènes sans besoin d'un logiciel spécialisé ou d'une formation en bioinformatique poussée contrastant fortement avec les pratiques courantes. L'utilisation d'un logiciel aussi répandu que Microsoft Excel suggère également que l'implémentation de cette technique ne sera entravée ni par le manque de logiciels ni par le manque de formation.

Cette étude sera prochainement publiée dans le journal scientifique "Journal of Experimental & Clinical Cancer Research".

Pour en savoir plus, contacts :
Thomas Hemmerling , McGill University, 845, rue Sherbrooke Ouest
Montréal (Québec), H3A 2T5 Canada

Source :
- http://www.newanesthesia.com/
- "Anesthésie transcontinentale : une première mondiale" - 10/09/2010 : http://francais.mcgill.ca/newsroom/news/item/?item_id=1674

Rédacteur :
Florent Bouvier

Origine :
BE Canada numéro 372 (24/09/2010) - Ambassade de France au Canada / ADIT - http://www.bulletins-electroniques.com/actualites/6459.htm
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